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杨效曾:用大数据把好基因组“暗物质”的脉2019-03-08


对基因组非编码区域功能的解析是目前国际上的研究难点也是研究热点,越来越多的研究表明,这些区域跟动物成长发育、对外界环境响应等方面存在重要功能。

为什么表白蛋白质的基因在基因组中的比例这么小?为什么基因组中有这么多“垃圾DNA”?

基因组“暗物质”显山露水

“可能说是无处不在,诚然是‘暗物质’,功能是既‘显山’又‘露水’,非常地重要。”看得出来,杨效曾对自己研究的领域有着极大的热忱。他认为,这个方向在将来会有重要的应用。“比喻2018年Science评出的10大科研进展里提到的RNAi药物,我们能够把相关的研究和方法用在作物改良、抗虫等领域。”

“那是因为基因组中有很多区域就像宇宙中的‘暗物质一样’,他们切实有很重要的功能跟作用,只是当初咱们对这些区域的理解还很有限。通过对大量组学数据的分析,我们对一些非编码的小RNA已经有了一定程度的理解,真是小个子、大角色。”首次会见,农业生物技能研究中心研究员杨效曾就热情洋溢地介绍起自己在非编码RNA范围的研究。

在美国弗吉尼亚大学读博士的时候,杨效曾就开端对这些“暗物资”感兴趣,通过高通量测序的方法鉴定和懂得这些非编码区域的功效。“那个时候在动物领域不现成的方法,我们最开始借鉴动物里边的研究方法,发现有很大的出入,于是我们开始研究植物里边这类非编码小RNA的特色,通过两年多的研讨,我们捕获了这些小RNA的特点,开发了本人的研究方法跟编写了相干的剖析程序。现在这套方法在国际上基本上成为了通用的方法,目前有近50个植物中用我们的办法鉴定小RNA。”杨效曾说。

杨效曾:用大数据把好基因组“暗物质”的脉

“咱们最近在原有措施的基础上做出了主要的改进,使这个方式更为准确、效率更高、速度更快。”杨效曾先容说,当初,这个方法已经对外公布在生物信息范畴的权威杂志上。



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